用人工智能读和说蛋白质的语言

来认识一下计算机科学专业的学生ananathan Nambiar。

2019年9月9日

专业:计算机科学

籍贯:马来西亚槟城和吉隆坡

论文指导:Mark Hopkins教授(计算机科学)和Anna Ritz教授(生物学)

论文题目:计算生命的语言

项目内容:我研究了使用自然语言处理和深度学习工具来将生物序列解释为一种语言。然后将这些技术用作基于非比对的方法,仅基于初级序列信息来预测蛋白质的功能。

它的真正内容是:如果蛋白质构成了一种语言,我们如何知道蛋白质的“意思”?

高中时:我有点好胜,坚持要把事情做好。

有影响力的里德课程:有三个课程对我在里德的时间产生了巨大的影响:与Andrew Larkoski教授(物理学)一起学习计算方法是我第一次正式接触到将数学和物理概念威博体育于现实问题所必需的技术。2. 在与Mark Bedau教授的《计算》(哲学)课程中,我获得了从哲学角度思考计算和人工智能的独特机会。这门课也让我参与了几个研究项目。3. 在我的论文中,马克·霍普金斯和安娜·里兹让我去追求一个非常跨学科的主题,尽管我不是一个跨学科的专业。

令我震惊的概念:普遍逼近定理表明,前馈多层神经网络是在实数的封闭有界子集上的任何连续函数的普遍逼近器。威博体育出一些假设)。

很酷的东西:我参加了计算机协会太平洋西北地区编程竞赛,在一个名为Algogriffins 2的团队中,我和Larkoski教授一起进行了一项独立研究,在那里我第一次接触到深度学习,通过使用神经网络研究希格斯玻色子衰变为一对tau轻子。我使用了来自欧洲核子研究中心大型强子对撞机的ATLAS实验数据。我做的另一件有趣的事情是在波特兰地区的几所小学为里德科学拓展项目教书。

我面临的挑战:搬到美国是相当具有挑战性的。像许多国际学生一样,我在里德之前从未去过美国。没过多久,我就意识到里德并不代表这个国家的总体情况。

经济资助:我拒绝了英国一所著名大学的全额奖学金,而是去了威博体育。如果我没有得到慷慨的经济援助,我是不可能做出这个决定的。

奖励,奖学金,助学金:学生机会补贴(SOS)奖学金,里德机会奖学金。

接下来要做什么:我将前往伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校攻读博士学位,并将与阿贡国家实验室合作,利用深度学习预测癌症药物和研究微生物生态系统。

标签:多样性/公平/包容,国际,学生,论文,什么是Reedie?